Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddx60E9PZQ1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ddx60E9PZQ1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms