Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ryr1E9PZQ0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ryr1E9PZQ0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms