Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5415E9PXF3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms