Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4931408C20RikE9PWP9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931408C20RikE9PWP9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms