Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms