Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FgaE9PV24 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms