Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8994E9PV04 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8994E9PV04 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms