Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl3E0CZ16 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl3E0CZ16 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms