Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh8D3Z6W3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms