Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms