Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptrhd1D3Z4S3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptrhd1D3Z4S3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms