Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim12cD3Z3L3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms