Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms