Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc6D3YZP9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc6D3YZP9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms