Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kif28pD3YXS5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif28pD3YXS5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms