Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc170D3YXL0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms