Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Catsperg2C6KI89 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms