Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clip3B9EHT4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms