Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah3B2RWG3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah3B2RWG3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms