Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rd3lB2RV38 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rd3lB2RV38 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rd3lB2RV38 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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