Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usf3B2RUQ2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usf3B2RUQ2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms