Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm4787B2RUD9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm4787B2RUD9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms