Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PtprbB2RU80 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PtprbB2RU80 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PtprbB2RU80 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PtprbB2RU80 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PtprbB2RU80 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprbB2RU80 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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