Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrt4B2RU40 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms