Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zscan5bB2RTN3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zscan5bB2RTN3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms