Protein–RNA interactions for Protein: B2RR88

Zfp964, EG636741 protein, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp964B2RR88 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp964B2RR88 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms