Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035947B2RQY6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC035947B2RQY6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms