Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Uhrf1bp1B2KF50 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1bp1B2KF50 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms