Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AU022751B1B0V2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AU022751B1B0V2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms