Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CK137956B1AYM9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms