Protein–RNA interactions for Protein: B1AX39

Zcchc7, Zinc finger CCHC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc7B1AX39 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zcchc7B1AX39 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms