Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf25B1AWN9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf25B1AWN9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms