Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Odf2A3KGV1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf2A3KGV1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms