Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc9bA3KGF9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms