Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf39A2RT81 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf39A2RT81 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms