Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931406B18RikA2RSL7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms