Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms