Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms