Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rtf1A2AQ19 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtf1A2AQ19 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms