Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tubb1A2AQ07 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb1A2AQ07 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms