Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn1aA2APX8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1aA2APX8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms