Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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