Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms