Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AI481877A2ALV5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AI481877A2ALV5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms