Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SetxA2AKX3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SetxA2AKX3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms