Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FocadA2AKG8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FocadA2AKG8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms