Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lcn6A2AJB9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lcn6A2AJB9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms