Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem185aA2AF53 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem185aA2AF53 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms