Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm16A2A935 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm16A2A935 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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