Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nlrp1bA1Z198 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp1bA1Z198 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms